神功皇后仲哀天皇応神天皇他六柱の神を祭る。平安時代に、この境内から｢香｣の良い水が涌き出たので、清和天皇より『御香宮』の名を賜ったといわれています。慶応4年（1868）、伏見鳥羽の戦いでは伏見奉行所に幕府軍が布陣。御香宮神社は官軍（薩摩藩）の本営となったが幸いにして戦火は免れました。